张永闻言，拍案勃然而起：“杨公此言是也，老奴何惜余年，定揭发巨奸，以报主上！”
由此，二人议定，也决定了刘瑾的命运。
阴历八月，张永回京叙功，杨一清仍留守，总制三边军务。
杨一清也真够受，成日提心吊胆，盼望张永事成，害怕失败。
刘瑾不知死。他获悉安化王造反被平定，竟侈然自以为功，矫旨给自己增加俸禄，又超拔哥哥刘景祥为都督。这位刘大哥福薄，刚接任命就病死，无福消受都督一职。
也可能出于某种不祥的预感，听术士说自己的侄孙刘二汉有天子命，刘瑾一时间竟起谋逆之念，在宅中广置甲杖，准备伺机起事。查其原意，本想借其兄刘景祥发丧时，百官送葬，他准备兴兵把众人一网打尽，然后率徒党弑明武宗，推侄孙刘二汉称帝。
其实，这位刘公公也是脑子一热发疯，侄孙当了皇帝，再怎样也不会让他这个太监爷爷当“太上皇”。
张永有心机，他先报称要在八月十五日入京献俘贺捷。刘瑾一边在京中加紧谋逆准备，一面让人告诉张永不必这么着急就入京。
张永闻此，公公们心意相通，更觉老刘要干大事，他就比预定日期更早一步，急急赶入北京献俘。
明武宗非常高兴，亲自在东华门参加献俘礼，大摆宴席，犒劳张永等人。
君臣多日不见，倍感亲切，明武宗、张永两个边喝边唠，渐至深夜。
刘瑾一旁陪得厌烦，起身告退，殿中只留下张永与皇帝二人在席。事实证明，历史上，无论是大人物还是小人物，不该睡觉的时候一定要忍住不睡觉，不该上厕所的一定要忍住不去厕所，否则，重则家族性命，轻则右派帽子，肯定没好果子吃。
见刘瑾退席还家，张永立刻从怀中取出安化王的檄文，指控刘瑾激变边塞，结怨天下，阴谋不轨。
对此，明武宗起初还敷衍，说：“算了，说这个干吗，喝酒吧。”
张永连忙跪地叩诉：“离此一步，老奴再无机会生见陛下！”
武宗闻此瞿然，问：“刘瑾想干什么？”
张永答：“他想取天下。”
武宗当时喝得很高，摇头一笑：“天下任他取罢了。”
张永大声疾呼：“刘瑾取天下，置陛下于何地！”
听此言，明武宗稍稍酒醒，方允其奏。张永完全依据杨一清教诲，马上派禁兵连夜逮捕刘瑾。
刘瑾正在熟睡，宫廷禁卫军撞门而入，刘瑾惊起。军将也不多说，命令把刘瑾立刻受逮入狱。
刘瑾倒不是特别惊惶，问：“皇上在哪里？”
军将回答：“在豹房。”（其实是和张永在一起）
刘瑾对家人说：“这事真是太可疑！”
但有诏逮人，他不得不从。
转日，众臣上朝，不见了大太监刘瑾，交头结耳，似乎知道了他已经“出事”，但没什么人敢声张。
京城内情势也很紧张，巡逻士兵大批大批骑马上街，交驰于道，严防刘瑾党羽生变。
起初，明武宗并没想杀刘瑾，毕竟多年老伴当，没功劳也有苦劳，没苦劳也有疲劳。
听说要把自己发配凤阳，刘瑾写信向明武宗哀乞，说自己被捕时没穿什么衣服，想让家人回家捎两件衣服给自己，以此试探皇上意思。
明武宗见帖，顿起怜意，命人交还刘瑾故衣百件。刘瑾得意，对看望的家人说：“我仍不失为一富太监矣。”
张永知道这件事，心内大惧，知道不马上重办刘瑾，哪天皇上“回心转意”，刘公公又会卷土重来要自己的命。
于是，张永下令有司以最快速度对刘瑾家宅进行抄搜。结果，“得金二十四万锭，又五万七千八百两。元宝（白银）五百万锭，又一百五十八万三千六百两。宝石二斗，金甲二，金钩三千，玉带四千二百六十二束，金汤盒五百，蟒衣四百七十袭……”
清单送上，这些骇人听闻的财物，并未让明武宗感到愤怒。让他勃然大怒的，是看到下列抄家搜得的东西：盔甲三千，衣甲千余，弓弩五百。
最终要刘瑾性命的，是搜得平日刘瑾在宫中陪侍皇帝时的一把扇子。这把扇子，让明武宗惊怒异常：扇骨内藏锋利匕首二枚！
“这王八蛋果真要造反啊！”武宗皇帝拍案顿喝。于是，他下令锦衣卫、法司把刘瑾押至午门，命朝臣廷讯。
刘瑾仍大大咧咧不在乎。在午门跪定，听闻给事中李宪也弹劾自己，他笑了，大声说：“李宪出自我门下，他也来弹劾我！”
刑部尚书刘璟素怕刘公公得紧，此时也噤口不敢开言。
见百官呆呆沉默，泥塑木偶一般，刘瑾更来了精神，大言道：“满朝公卿，皆出我门，谁敢审我？”众人闻言屏息。
此时，驸马都尉蔡震上前，扬手给了刘瑾一个嘴巴，怒喝道：“我乃国戚，不出汝门，待我审汝！”
此时，内廷又有武宗旨意传出，“打四十”。于是，五棍一换打，八名大汉轮打，一顿杀威棒，终于打消了刘瑾的嚣张气焰。
蔡震问：“为何家中藏甲？”
刘瑾：“用来保卫皇上。”
蔡震大喝：“藏甲于自己家中，如何保卫皇上！”
刘瑾语塞。这时，又有官员上前宣读抄家所得禁物，刘瑾知道事已败露，只得承招。
由于又挨打又挨夹棍，最后画押时，刘公公连笔也拿不住，揉手半天，才颤巍巍画成一个十字，算是画招认罪。
自供状呈上，武宗皇帝表示不用复审，下诏对刘谨处以凌迟之刑。
至于刘瑾受刑挨剐的详情，正史皆略，但当时监斩官张文麟为刑部河南主事。此人文人出身，退休后写书，详详细细记录了刘公公被剐三千三百五十七刀的经过：
（刘瑾）凌迟刀数例该三千三百五十七刀（不知是怎样“科学”计算出的如此刀数），每十刀，一歇一吆喝（类似卖肉表演），头一日，例该先剐三百五十七刀（先剐零头，后来好计数）。（所剐之肉）如大指甲片（大小），在胸膛左右起，初动刀则有血流寸许，再动刀则无血矣（刀少，血易凝结）。（旁）人言，犯人受惊，血俱入小腹小腿肚，剐毕开膛，则血皆从此出（不知是否合医理）。至晚，押瑾至顺天府宛平县寄监，释缚数刻，瑾尚能食粥两碗（保留元气，留待慢慢剐），反贼乃如此。次日，则押至东角头（第一日在西角头）。先日，瑾受刑，颇言内事（泄露国家机密，骂领导人），以麻核桃塞口，数十刀气绝……奉圣旨，刘瑾凌迟数日剉尸免枭首……，剉尸，当胸一大斧，胸去数丈。
张文麟目见耳闻，当可足信。但就是凌迟数与天数含混，他笔记中只记录凌迟当日和次日，依理应凌迟三天。第一天剐了三百五十七刀，而他描写次日时，“数十刀气绝”，不知是如何凑算成律定的“三千三百五十七刀”，可能是漏记，也可能行刑记数另有讲究。
但有一点非常可信：刘公公以近六十之年受剐，死得非常非常痛苦。但想想他从前害死那么多人，四位朝中御史犯小过也被他凌迟，就觉得这也真是上天有眼，罪有应得。
行刑之时，昔日受害家属“争买其肉啖之，有以一钱易一脔者”。生吃仇人肉，也算替亲人报仇了。刘公公日日山珍海味，身上之肉味道应该不算质量太差。
刘瑾不仅是一人被杀，其亲属，包括有“天子之相”的刘二汉，一共二十五人，皆被斩首示众。好在他哥哥刘景祥死的是时候，否则也被从家中拖入闹市砍头。
至于刘瑾党羽，前大学士焦芳、刘宇以及现任户部尚书刘玑等人，皆被削籍为民。只有张彩最倒霉，他在刘瑾败后被逮入狱，严刑拷打。
张彩大呼冤枉，狱中上疏，指斥阁臣李东阳等人也阿附刘瑾。
此时，张永大公公非常有定力，对众臣讲：“刘瑾用事时，我们这些人都不敢言声，甭说两班官员了！”言外之意，是保护李东阳。
锦衣狱内吏卒希旨，对张彩夹棍、脑箍、灌鼻、钉指、“鼠弹筝”、“拦马棍”、“燕儿飞”，一齐用上，老美男子没几天就被折磨死，仍被“剉尸市中”。
诛杀刘瑾后，根据廷臣所奏，把刘瑾变易的“成宪”尽数更回，共吏部二十四事，户部三十余事，兵部十八事，工部十三事，禁令各地镇守太监干预地方刑名政事，并罢内行厂与西厂。日后，特务机构之一的西厂未再重设。
这时候，明武宗已经是二十岁小伙子，不再是事事依赖太监玩伴的少年人。此后十年，他沉浸在“豹房”的天地一家春淫乐与四处巡游的玩乐中，诱导他失德的不再是内廷公公，而是外镇军官江彬一类人。
“阁臣自（刘）瑾党败后，所用亦非甚不肖，时士大夫风气未坏，特资擢用，所得亦多正人，而帝（武宗）之不可与为善，则童昏其本质也。”（孟森语）
刘瑾乱政，确实引起社会动乱。他被杀两个月后，河北地区就有刘六、刘七起事；四川保宁刘烈率众造反进攻陕西，不久廖麻子等人也自称“扫地王”，众达十余万，肆掠陕西、湖广等地；江西方面，也陆续有王钰五、汪澄仁、何积钦等人造反。可幸的是，明朝刘晖、王守仁、彭泽等人善战善抚，几年内陆续平乱，没对明朝政府造成伤筋动骨之患。
现在，该交待一下诛杀刘瑾的主策划杨一清和张永。
在张永援引下，杨一清在刘瑾败后入朝，拜户部尚书，不久改吏部尚书，加太子少保。