吴之荣得不到好处，发现《明书》中仍采用明崇祯年号，为了恢复官位不惜诬陷为反书。
第三集
双儿见吴六奇饥寒交迫，温柔地带他回家避雨和吃饭，六奇誓言会报一饭之恩。吴之荣得到鳌拜背后支持，令到庄家三十多人含冤入狱，而小宝正要设法救双儿，在狱中巧遇茅十八。小宝涉嫌协助茅十八越狱，被官府追捕，春花为了儿子的安全，吩咐小宝暂离扬州。
庄家一行三十多人被下令押往京城受审，小宝请求茅十八上京拯救双儿。康熙宅心仁厚，劝鳌拜为苍生着想从轻处理庄家一案。
第四集
小宝到京遇上女扮男装的沐剑屏和方怡，双方发生冲突。海公公藉词试探瑞栋是否会使用化骨绵掌，交手之下才知瑞栋幕后还有主使。
鳌拜认为康熙只是个小皇帝，不听劝告，自作主张处决庄家各人，小宝得知便和茅十八赶往刑场，巧遇天地会一群反清义士也到刑场，欲行刺鳌拜。
鳌拜已预料天地会会动刑场，早设下天罗地网。天地会青木堂的尹香主在此役中身死，舵主陈近南得到吴六奇相助，死里逃生。
沐王府成功地将吴三桂送给鳌拜的金银财宝夺走，而刘一舟乘机把一金钗偷走，转送给方怡，以博取欢心。
第五集
海公公擒得茅十八及小宝，查问来京目的，为斩草除根欲杀二人，小宝暗中在他的药中加重分量，令他变成瞎子，并将小桂子杀死而冒充他来服侍海公公。
康熙见罗刹国大炮威力无穷，欲借助汤若望之力制造，设法让鳌拜释放他。
鳌拜和苏克萨哈在处理汤若望事件上有严重分歧，鳌拜心感不满。
小宝偷入练功房巧遇小皇帝康熙，在不知他是皇帝的情况下教训他一顿，康熙也自称小太监小玄子与小宝结交，一起玩摔跤。
第六集
康熙与鳌拜在处理苏克萨哈有严重分歧，引起鳌拜的愤恼，幸得小宝机智把鳌拜的气焰消除，而小宝也知道小玄子就是当今皇帝康熙。
建宁公主假扮宫女，要小宝带她离开宫中，但被侍卫揭发公主身分，不欢而散。
鳌拜不满康熙维护苏克萨哈，为了显示自己的势力，给康熙一个下马威，私自假传圣旨把苏就地处决。同时，鳌拜一方面诈病不上朝，另一方面又大宴亲信，上演一幕龙袍加身，企图谋夺帝位。康熙深知也无可奈何。
第七集
康熙为了让鳌拜以为他安于逸乐，不问朝政，于是寄情摔跤，而小宝只好陪伴在侧。建宁公主在宫中无理取闹，令到宫女及侍卫退避三舍，一日看见小宝经过，强迫小宝一起玩，且烧了小宝的辫子，小宝气愤下痛打建宁，但建宁非但不怕反而欢喜，原来她有被虐狂。
康熙看见鳌拜对自己戒心消除，认为是消灭鳌拜好时机，于是和小宝突袭鳌拜，并讹称鳌拜行刺皇上。
第八集
鳌拜欺君犯上被监禁，康熙下令抄家，并派小宝到鳌家寻找四十二章经。小宝从中获得锋利的小刀及护甲衣两件宝物。
太后得知小宝擒拿鳌拜有功，升为六品首领太监，但小宝正等待机会离开皇宫。
鳌拜在牢中经常胡言乱语，康熙恐怕鳌之余党反抗，暗示小宝将鳌拜消灭，当小宝正在暗杀鳌拜之际，巧遇天地会也前来刺杀鳌拜。
第九集
小宝梦到自己开妓院，开心得哈哈大笑，醒来见海公公一惊。海公公道出在汤中下毒，逼小宝说出谁指使他潜伏自己身边。
入夜，海公公到慈宁宫找太后，告之有关顺治帝在五台山的消息，且查明瑞敬皇后及荣亲王是被太后所杀，于是双方大打出手，两败俱伤，小宝乘机把海公公杀死。太后欲杀小宝灭口，幸康熙适时出现。
第十集
小宝在误打误撞之下，将鳌拜杀死，却被天地会众人捉走。
小宝在天地会青木堂内遇到茅十八，才得以保存生命。康熙知道小宝被捉，非常震怒，逼康亲王及索额图尽快寻回。
总舵主陈近南看见天地会众兄弟，为了争夺香主之位而内讧，于是收了小宝为徒，并让他继位青木堂香主。
第十一集
小宝毒发，陈近南为他施内功逼毒出来，小宝感激不尽。小宝藉词出宫打听鳌拜余党，乘机散心，但被建宁公主得悉，威迫小宝带她一起离开皇宫，小宝无奈答应。
建宁公主刁蛮任性，令天地会误会将她打伤，小宝因而被康熙责骂。
天地会布下天罗地网，想把吴三桂之子吴应熊杀死，后因沐王府的白寒枫和白寒松阻止，天地会惟有将计划搁置。
天地会徐天川与沐王府双白因为谁是光复大业的正统而引起争执，导致徐天川伤重垂危，白寒松丧命。天地会认为沐王府为了寻仇而将徐天川捉走，于是冲入沐王府把沐剑屏带走。
第十二集
三藩藩主自请撤藩，康熙心知他们用意，佯怒拒绝。
小宝藏剑屏于宫中，为恐建宁发现，诈称见海公公鬼魂骗她回寝宫。
应熊作客于康亲王府，其手下皆武功非凡，王府中人挑衅亦忍让，小宝佩服并暗中笼络。众人企图在赌桌上笼络小宝。
小宝无意中发现齐元凯买通王府下人得一本四十二章经，于是他轻易盗去经书，回宫后将在王府所见告诉康熙，康熙从中猜测吴三桂已秘密上京，且有意谋反，着小宝找机会查探其虚实。
第十三集
太后欲以配婚平息三桂谋反之心。建宁告诉太后小宝曾见到海公公鬼魂，太后决杀小宝免有后患，但反被小宝所伤。剑屏闻刺客用其沐王府中暗号，并求小宝带方怡回房内疗伤。小宝为方怡疗伤仍不忘调戏一番。
太后派瑞栋杀小宝，反被小宝所杀并取去他身上的四十二章经。太后又派太监骗小宝至其寝宫欲杀小宝，却被他机灵识破，终要亲自下手，小宝讹称已得悉太后秘密逼太后放手。
康熙问小宝杀刺客的经过，小宝顺势称赞康熙教导武功有方，康熙推测刺客非平西王府中人。
第十四集
康熙教小宝拿着证物敲诈吴氏父子。小宝一时贪玩，竟要三桂服侍，三桂露出杀机。小宝戏弄三桂后回宫禀明康熙，并用部分应熊所赠之银两收买人心。
沐剑声救出徐天川，却要天地会为天川误杀白寒松一事作出交代，小宝以香主身分答应救出沐王府刺客以抵天川之过。
康熙欲放走刺客以引出主谋，小宝顺水推舟救出刘一舟等三人，可惜中途遇到建宁，建宁带走一身太监打扮的一舟，及发现一舟非太监时，施以酷刑当玩意，幸得小宝相救出宫。
第十五集
近南抵京探望小宝，沐王府人等为答谢天地会相救与近南见面，惜双方各为其主，为太子正统问题再起争执，场面一触即发。近南提出先杀三桂的一方就可号令另一方手下恢复大明的协定，众和议。
小宝向康熙说出刺客之主谋及嫁祸太后所派的太监，康熙带小宝向太后请罪，太后借故留下小宝在身边。太后派柳燕跟小宝回房取四十二章经，方怡刺毙柳燕后与小宝、剑屏出宫，却遗下订情的珠钗，小宝回房取钗时发现柳燕的断脚并未化去，决用来吓太后，却意外偷听到太后与师兄的对话。小宝乘机偷走三本四十二章经，却见到了正前来盗经的宫娥陶红英。
第十六集
小宝将出身到入宫及至发现真太后，一一告诉康熙，康熙得知太后秘密后大怒，与小宝窥探太后，果然发现死去的宫女为男人所扮。康熙为怕打草惊蛇，只派小宝到五台山找顺治帝。
建宁突出现，康熙因太后的事迁怒建宁，建宁大发脾气，捣乱御厨。小宝籍出宫带走方怡及剑屏，托天地会的人护送二女到石家庄，分手时三人依依不舍。
第十七集
小宝与方怡及剑屏分手后，途中遇险得陶红英相救，并告知神龙教与四十二章经的秘密。
一舟发现方怡的心倾向小宝，决杀小宝，却反着了小宝道儿，更在众人面前出丑。
天降大雨，众人入破庙避雨，一舟见方怡与小宝态度亲昵，一怒打断木柱，破庙倒塌。小宝等人到庄家鬼屋避雨遇章老三，章老三向他们打听桂公公下落，一舟为自保说出小宝即桂公公。小宝讹称受太后指使上五台山，又说太后杀了柳燕及其师兄，章老三信以为真。
第十八集
小宝与沐王府等人被章老三捉着，幸获庄家众"女鬼"相救，且重遇双儿，但方怡、剑屏却为章老三掳走，要小宝带四十二章经往神龙岛换人，三少奶为报恩亦将双儿终生交托小宝。
小宝二人路上遇贼喇嘛，得知他们欲往五台山清凉寺找顺治麻烦，遂赶上营救。
小宝乔装善信要亲手赠寺内众僧礼物，却不见顺治踪影。巴颜率众喇嘛藉口要找被擒小喇嘛实捉顺治，被小宝使计，再合双儿、行颠及澄光之力制服。玉林示意澄光释放巴颜，又拒绝小宝见顺治，小宝担心顺治安危，决半夜潜入"偷"走顺治。
第十九集
巴颜率数十喇嘛折返要烧清凉寺，幸少林寺四大金刚及十数罗汉赶至，将他们击退。顺治交小宝四十二章经，着其转交康熙，并要他紧记"永不加赋"四字。小宝与双儿下山时遇胖头陀，小宝被擒及被迫交出经书，幸四大金刚及众罗汉相救，并沿途护送返京。